Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms