Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NESP48681 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NESP48681 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
NESP48681 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
NESP48681 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
NESP48681 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
NESP48681 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
NESP48681 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
NESP48681 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NESP48681 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NESP48681 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NESP48681 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NESP48681 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NESP48681 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NESP48681 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NESP48681 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms