Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT2P45379 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT2P45379 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms