Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms