Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms