Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJA4P35212 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA4P35212 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA4P35212 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA4P35212 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA4P35212 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms