Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX2P32243 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms