Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms