Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms