Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms