Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNCP24821 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNCP24821 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms