Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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