Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCEA1P23193 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TCEA1P23193 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms