Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD33P20138 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD33P20138 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD33P20138 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms