Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B1P20020 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms