Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms