Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms