Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB3P16520 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms