Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms