Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms