Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TOP2AP11388 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2AP11388 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms