Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms