Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD28P10747 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD28P10747 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD28P10747 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD28P10747 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD28P10747 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms