Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HKR1P10072 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HKR1P10072 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms