Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms