Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM228BP0C875 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms