Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC3P02656 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms