Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms