Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYF2O95926 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYF2O95926 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms