Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP4K4O95819 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP4K4O95819 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms