Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms