Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms