Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms