Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA2O94983 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA2O94983 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA2O94983 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA2O94983 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA2O94983 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms