Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEBLO76041 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEBLO76041 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms