Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOX1O75936 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms