Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNMDO75829 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNMDO75829 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNMDO75829 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNMDO75829 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNMDO75829 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms