Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF6O75683 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF6O75683 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF6O75683 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF6O75683 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF6O75683 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF6O75683 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms