Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMFO60524 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMFO60524 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEMFO60524 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms