Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms