Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPAG9O60271 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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