Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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