Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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