Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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