Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms