Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms