Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms