Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2LO15068 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2LO15068 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms