Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMBP2O15034 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMBP2O15034 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms