Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIP1O00291 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIP1O00291 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIP1O00291 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms